找到刚刚杀死团藏的小樱欺骗佐助要背叛木叶加入他的队伍，佐助开出条件是要小樱动手杀掉香璘。就在小樱准备用毒苦无刺杀佐助时，佐助早已先下手为强想杀害小樱，跟踪许久的卡卡西飞身救下小樱，并与佐助对战。卡卡西明白佐助真的堕落了。
想到了第七班的过去，他决定自己要背负这个重担，于是与佐助展开战斗。卡卡西指出自己不想杀佐助，并劝导他放弃复仇，但这更加深了佐助的愤怒，使出了须佐之男完全体攻击卡卡西。卡卡西躲避不了便使出神威勉强将须佐的箭转移到异空间。
佐助的眼睛因为过度使用而突然失去了光明，而小樱在身后欲攻击佐助，然而却举棋不定。佐助毫不留情地攻击了小樱，而卡卡西因为使出了神威导致身体反应迟钝，已经赶不上去救小樱，幸而鸣人及时赶到使小樱免遭其害。
忍界大战
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五大忍国与“宇智波斑”之间的战争，忍者联军八万忍者集结主要分为五大连队。第三部队是中短距离支援部队，由兼备速度和体力的忍者构成，由旗木卡卡西担任队长。卡卡西结束和被秽土转生复活的雾隐七人众的战斗后，与阿凯在“斑”欲吸收鸣人的一瞬间夹击“斑”，但被带土发觉并且躲过，但救出了鸣人。在与“斑”的对战中因不敌“斑”，而与被“斑”召出的尾兽僵持，僵持一段时间后，尾兽集体准备发出尾兽玉攻击卡卡西与阿凯，危急时刻，卡卡西欲使出神威将尾兽玉转移，阿凯却认为尾兽炮过于巨大无法全部转移，欲牺牲自己开八门遁甲的第八门死门来抵挡尾兽炮，最终被鸣人尾兽模式所救，“宇智波斑”使用九大尾兽的查克拉复活十尾，忍者联合军抵达战场，在五忍村的接连攻击下将十尾暂时控制住，此时卡卡西已精疲力尽。
此后被鸣人传输了九尾的查克拉以后，体力恢复。鸣人用螺旋丸攻击带土，“斑”用宇智波团扇反弹。鸣人使出袖珍尾兽玉向“斑”发动攻击却穿身而过。迈特凯的攻击也是穿身而过。鸣人四人碰不到“斑”之身。一切皆为徒劳。
卡卡西趁机用神威试图拧下外道魔像的脑袋，被带土神威解除。鸣人等无法对魔像下手，只能先击败“斑”。卡卡西扔了一只苦无，还是穿身而过，苦无飞向鸣人。苦无被卡卡西用神威传送走。攻击结束后，带土面具上多了一道裂痕。卡卡西认为产生裂痕的成因是被传送到异空间的苦无！卡卡西的神威异空间和面具男异空间相通！随后在异空间把带土炸伤的螺旋丸证明了这一点。
卡卡西质问面具男：“你是从哪得到那只眼睛的！？”“宇智波斑”回答：“是在神无毗桥之战！”卡卡西震惊地准备说出面具男的名字。卡卡西用神威将鸣人分身转移到异空间，“斑”未注意。在异空间“斑”面具被鸣人分身螺旋丸打碎。宇智波带土的身份终于呈现出了。
卡卡西质问带土为什么走上这样一条路，带土冷冷的回答：“我的生死已经无关紧要了..如果要问我为什么会活下去的话……也是……因为你对琳……见死不救！”卡卡西质问带土，你为什么要和那样的人渣联手。带土回应卡卡西：“我对你已经无话可说，剩下的..只有这最后的决战！
带土将查克拉变为数十个巨型螺旋手里剑扔出，卡卡西发动土遁防御，但被带土穿过。卡卡西问为什么，带土说闭嘴废物。砍伤卡卡西的腿，阻止卡卡西逃跑用神威将其吸入异空间。卡卡西怀念少年带土，承认自己是个废物说：“带土对我而言....你一直是个英雄....”。卡卡西神威扭开异空间出来。卡卡西再问带土为什么会变。带土转身跳起用膝盖重创了卡卡西，用双十字手里剑戳穿卡卡西胸膛，瞬间血流不止。卡卡西忍痛说：“...木叶的英雄...为什么会走到这个地步...”带土回应：“在这个苟活的忍者世界里，谁都会变成废物！包括你我！所以我决意要摧毁它，创造一个新的世界！”。“废物就别发声了，去死吧卡卡西！”。鸣人说我绝不会让同伴受伤！分身保护了卡卡西。卡卡西看着鸣人说：“带土，你昔日的意志仍与我同行。我现在能做的，就是保护好活着的鸣人！”带土使出木遁束缚住九尾鸣人，要用神威再将卡卡西吸入，但正处于虚弱的卡卡西被吸入进去后就无法有发动神威的查克拉，一旦被吸入就无法出去。情急之下无法动弹的的鸣人用脑门撞了带土。带土被撞飞。这时九尾把大量查克拉传给了卡卡西。带土却趁机把卡卡西吸到异空间.......九尾攻击带土，带土虚化。
在异空间的卡卡西趁机袭击带土。带土被重伤。
带土和卡卡西进入了异空间进行单独对决。两人宿命的决斗开始。琳当年的死因大白，原来琳是自愿死在卡卡西的雷切下的，而宇智波带土竟然知道这一切。宇智波带土露出胸膛，而里面竟然没有心脏：“你给我好好看看清楚，我的心已空无一物！就连疼痛都无法感觉到！丢掉那所谓的愧疚之心吧.卡卡西，掏空这个风穴的正是这地狱般的世界！”
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