波之国任务
三人正式成为下忍后，一向从事的都是D级任务，如找宠物、清洁河道等，鸣人本身亦有怨言。[13]终于他们获得护送重要人物的C级任务，其内容就是要安全护送桥梁建筑师达兹纳先生返回波之国。[14]
在卡卡西的带领下，他们陪同达兹纳出发。但途中遇上来自雾隐村的敌人，鸣人因从未有实战经验，心有恐惧，手背中毒；[14][15]相反佐助及樱表现镇定。鸣人于是通过划破手背放毒来表明决心。
之后他们遇上更强的敌人——叛忍桃地再不斩。当卡卡西被再不斩以水牢术困住时，鸣人与佐助配合使用佯攻战术吸引再不斩的注意力，解开了对卡卡西的束缚。[16]卡卡西击败再不斩后，指导鸣人、佐助和樱如何控制查克拉。鸣人和佐助互相竞争，最后均能爬到树顶。[17]鸣人他们寄宿在波之国伊那利家里；同时他认识了一名神秘少年。
不久，再不斩带着拥有血继限界的少年白再度出现，向第七班复仇。白与佐助交手。此时鸣人打败卡多派来绑架伊那利一家的两名手下后，[18]匆忙赶到的他却鲁莽地冲进了白的陷阱。佐助唯有利用刚开启的写轮眼应付白的行动，同时掩护受重伤的鸣人。
白利用这一弱点，攻击鸣人使佐助露出破绽。佐助明知是计，却用自己的身体掩护鸣人，身受重伤倒下。鸣人误以为佐助被杀，愤怒之下使出九尾的力量击败白。白的面具脱落，鸣人才知道他原来是先前所认识的那位少年。白承认自己输了，请求鸣人杀掉他；然而白感到再不斩处于危险中，向鸣人道歉并离去，并为再不斩挡了卡卡西的致命一击。
当鸣人得知白的死讯后，向看似冷漠的再不斩讲述了白对他的忠诚和情谊，让再不斩这个铁血之人流下了眼泪。
再不斩因此牺牲了自己的性命，反过来把作恶多端的卡多杀死。而佐助不久亦从昏迷状态中苏醒过来。第七班顺利完成任务，准备返回木叶。达兹纳为感谢鸣人相助，把新桥梁命名为“鸣人大桥”。[19]
中忍考试
第七班返回木叶又执行了一些琐碎的任务后，木叶准备举行中忍考试。鸣人、佐助及樱三人最终亦决定参加。
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第七班
第一轮是笔试，亦是鸣人觉得可怕的测试，碰上主考官又是暗部所属审讯部长，擅于操控对方精神，被称为“虐待狂”的森乃伊比喜。幸亏伊比喜是想考验考生的心理，故鸣人虽一条问题也没答，仍成功过关，被伊比喜认为相当有意思。[20]
第二轮是生存试练，在死亡森林内与其他考生争夺用来晋级的“天之卷轴”和“地之卷轴”。第七班途中遇上伪装成草忍考生、已叛离木叶的大蛇丸。佐助对大蛇丸所召唤的大蛇有些害怕，鸣人用激将法使佐助振作起来。
但实力悬殊，佐助被大蛇丸在脖子上留下天之咒印，并晕了过去。鸣人亦中大蛇丸的五行封印，九尾查克拉被封印起来而昏迷过去。樱只得自行照顾佐助及鸣人。[21]鸣人、佐助苏醒过后，三人又继续考试，但考试时间快到，始终仍欠缺卷轴。幸得之前认识的药师兜指点，击败三名雨忍成功夺取卷轴过关。
第三场考试分预赛及淘汰赛。鸣人的预赛对手是犬冢牙和赤丸。牙的秘术一度使鸣人处于下风；但鸣人却用计令牙误伤赤丸，又因突然放了一个屁，严重影响牙的进攻，用自创的鸣人连弹打败了牙。赛后，鸣人受到“三忍”之一自来也的帮助，解除五行封印，又学会了控制查克拉和通灵之术。
进入淘汰赛，鸣人遇上有“天才”之称的日向宁次，被宁次的攻击封住穴道而使不出任何查克拉，但因赛前得到指点，释放九尾的查克拉击败宁次，获得全场欢呼。
众人回到木叶后，却收到三代火影在与大蛇丸的对决中牺牲的噩耗。
三忍决战
火影位置空缺；自来也带鸣人寻找纲手，纲手一开始瞧不起鸣人，对鸣人成为火影的理想感到可笑，之后与鸣人约定，要是鸣人三天内学会螺旋丸，就把项链给他，鸣人为实现约定而努力修炼螺旋丸。
修炼螺旋丸
后来三忍决战结束后，纲手被鸣人感化，决定回到木叶担任火影，又按约定把项链送给鸣人，把一切希望都托付在鸣人身上。
追捕佐助
经过前次的任务，佐助深感自己的力量不足，而心生嫉妒，欲追求更强大的力量，以向哥哥鼬报仇。此时大蛇丸的部下“音忍四人众”来到木叶，劝诱佐助投靠音隐，佐助亦为所动而准备叛离木叶，临行前把前来劝告的樱打晕。木叶虽收到佐助叛离的情报，但因之前受到砂忍及音忍的攻击，百废待兴，只能派鸣人、鹿丸等人前去追捕。
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第二次终末之谷的决斗
临行前，鸣人与樱定下约定——把佐助带回木叶。然而，鸣人一行人途中分别遇上“音忍四人众”的阻挠，而伙伴们亦豁出自己的性命让鸣人追上佐助。但却又突然杀出了拥有血继限界的强敌君麻吕，鸣人试图用影分身之术对付君麻吕，但不起作用；幸好李洛克和我爱罗及时感到，使自己可继续追赶佐助。
营救我爱罗
第七班收到紧急增援砂隐的任务，三人到达“晓”聚会的地点拯救被抓去的我爱罗，但为时已晚，我爱罗已被抽出尾兽而死。鸣人欲营救我爱罗，因而被“晓”成员——迪达拉所挑衅。卡卡西不安心，跟鸣人一起出发，并劝鸣人要冷静下来。鸣人配合卡卡西将迪达拉击落，取回我爱罗的遗体。确认我爱罗已死后，鸣人情绪激动，九尾查克
拉外漏，形成妖狐外衣，攻击迪达拉。卡卡西见状，立刻用自来也给的符把鸣人制住。迪达拉被前来支援的第三班和第七班围攻，用自爆分身溜之大吉，战斗结束。
拯救我爱罗
鸣人所表现的真挚友情感动了千代婆婆，她于是牺牲自己的性命用转生之术令我爱罗复活。我爱罗回归砂隐村，砂隐的民众十分欢迎我爱罗回来，我爱罗第一次感到被其他人肯定的感受。故鸣人准备返乡时，我爱罗心存感激，双方的握手，代表着永恒的友谊。
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